9 марта 2017 года на заседании Комитета Государственной Думы по обороне обсуждался проект федерального закона "О внесении изменений в Федеральный закон "О воинской обязанности и военной службе" и статьи 25 и 61 Федерального закона "Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации"", готовящийся ко второму чтению. Одним из его положений предлагается отменить надбавки к стипендии для студентов, обучающихся на военных кафедрах.

В установленный срок депутатом Алексеем Чепой было внесено предложение об исключении этой нормы, что позволило бы и дальше выплачивать студентам, обучающимся на "военке", надбавку к стипендиям.

В ходе прений представители Министерства обороны в обоснование своей позиции заявили, что, поскольку обязательный призыв на военную службу выпускников военных кафедр отменен, то нужды выплачивать стимулирующие надбавки, нет.

В свою очередь депутат-справоросс заявил: "Я сам заканчивал Московский авиационный институт и сейчас поддерживаю с ним самые тесные отношения. Я помню, как обучались тогда на военных кафедрах, и практически все выпускники потом шли в армию и служили, причём служили многие не хуже, а, наверное, даже лучше тех, кто заканчивал военные училища".

Кроме того, парламентарий отметил, что обязательный призыв на военную службу для выпускников военных кафедр был отменен с 1 января 2008 года, в то время как выплату дополнительной стипендии решили отменить только спустя девять лет. В качестве дополнительного аргумента Алексей Чепа привел тот факт, что при поступлении на военную кафедру студент приобретает комплект военной формы за свой счет, в то время как призывнику-"срочнику" она выдается бесплатно.

Также в своем выступлении Алексей Васильевич обратил внимание членов комитета на некоторые неточности в финансово-экономическом обосновании законопроекта.

В ответ представители Министерства обороны, заявили, что, поскольку на военных кафедрах теперь будут готовить также рядовой и младший командный состав, для которого надбавка к стипендии не предусматривается, было бы справедливым отменить её для будущих офицеров.

Члены Комитета, представляющие партию "Единая Россия", добавили, что конкурс при поступлении на военную кафедру крайне высокий, что свидетельствует о престижности получения военно-учетной специальности, поэтому в дополнительной мотивации в виде денежных надбавок они не нуждаются.

"Я хочу только напомнить, что у нас стипендия средняя у студентов – чуть больше 1 тысячи 400 рублей. И когда мы здесь рассуждаем, правильно ли отменять какие-либо надбавки, важно помнить, что для них, и это – определённая сумма денег. Прошу Вас подумать ещё и над этим" – обратился Алексей Чепа к своим коллегам в заключительном слове.

Отметим, что речь шла о ежегодной экономии для бюджета 104,5 миллионов рублей. В настоящее время факультеты военного обучения и военные кафедры функционируют в 68 высших учебных заведениях, среди которых МГТУ им. Баумана, СПбГУ, МГУ им. М.В. Ломоносова, Высшая Школа Экономики, Финансовая академия при Правительстве РФ и т.д. Масштабное сокращение данный институт претерпел в 2008 году.

В том же году были упразднены военная кафедра при Тверском государственном техническом университете и кафедра военной и экстремальной медицины при Тверском государственном медицинском университете.